Η ταινία ΚΑΠΟΔΙΣΤΡΙΑΣ είναι η ιστορία του μεγαλύτερου Έλληνα πολιτικού. Ορμώμενος από τη νήσο Κέρκυρα της Ελλάδος στις αρχές του 19ου αιώνα διέπρεψε ως Υπουργός Εξωτερικών της Ρωσίας. Με την προτροπή και την στήριξη του Τσάρου Αλέξανδρου του Ι της Ρωσίας συνέβαλε στην ανεξαρτησία της Ελβετίας και της Ελλάδος, αλλά και στην διάσωση της Γαλλίας από τον διαμελισμό της μετά την ήττα του Ναπολέοντα.

Η σχέση αυτή του Καποδίστρια με τον Τσάρο Αλέξανδρο χτίζεται πάνω στις κοινές τους οικουμενικές και για τον καιρό τους προοδευτικές ιδέες, στον βαθύ αλληλοσεβασμό, καθώς και στην αγάπη και εκτίμηση που αιώνες τώρα συνδέουν τους δυο λαούς,  Έλληνες και Ρώσους.

Ωστόσο, οι ιδέες αυτές θα τον φέρουν αντιμέτωπο με τον αντιδραστικό και δαιμόνιο Καγκελάριο της Αυστρίας τον Μέτερνιχ, ο οποίος θα γίνει η πηγή μεγάλων συγκρούσεων. Παρ’ όλα αυτά, οι ιδέες και η δράση αυτών των δύο μεγάλων Ανδρών, του Τσάρου και του Καποδίστρια, θα δημιουργήσουν ένα καινούργιο πνεύμα και θα βάλουν τα θεμέλια για μια νέα Ευρώπη. Μετά την καθοριστική επέμβαση της Ρωσίας, η Ελλάδα αποκτά την ανεξαρτησία της και ο Καποδίστριας εκλέγεται πρώτος Κυβερνήτης της ελεύθερης Ελλάδος.

Ανυποχώρητος στις αξίες του, αντιμετωπίζει με στωικότητα τις διώξεις, τόσο στην Ευρώπη όσο και μετέπειτα στην Ελλάδα, υπερασπιζόμενος με σθένος, καλοσύνη και αξιοπρέπεια την ελευθερία του κάθε ανθρώπου, θυσιάζοντας ακόμη και τον μεγάλο έρωτα της ζωής του για την Ρωξάνδρα Στούρτζα.

Η ζωή του Ιωάννη Καποδίστρια είναι μια ιστορία αγάπης, πίστης και αγώνα ενός οραματιστή δημοκράτη σε συντηρητικούς καιρούς, πληρώνοντας με τη ζωή του την αγάπη του για την πατρίδα.